Скачанные deb-пакеты хранятся в папке /var/cache/apt/archives. По умолчанию система управления пакетами настроена таким образом, что сохраняет все пакеты, когда-либо скачанные и установленные.

Посмотреть, сколько места занимают на диске эти пакеты можно командой:

du -sh /var/cache/apt/archives/

Управлять политикой сохранения пакетов и очистить кеш пакетов можно через менеджер пакетов Synaptic. Для этого необходимо зайти в меню Настройки→Параметры, и перейти в открывшемся окне на вкладку «Файлы».

Для удаления скачанных пакетов из кеша через терминал воспользуйтесь командой:

sudo apt-get clean