Выбранный в Nautilus файл или папку можно открыть в терминале через контекстное меню. Для этого необходимо установить пакет nautilus-open-terminal через Synaptic или командой

sudo aptitude install nautilus-open-terminal

После этого в меню появится новый пункт - «Открыть в терминале».

Возможно вам придётся перезапустить X-сервер или перезагрузить компьютер, чтобы новые пункты появились в меню.