Рассказ по большей части основывается на личном опыте, и если у вас есть опыт, здесь не описанный, то будьте любезны, дополните статью.
Windows не тонет.

Конечно же, мир не идеален и существуют задачи, поставленные так, что их нельзя решить без использования windows.
Например, задача автоматизации работы конструкторского отдела имеет в своей постановке следующее требование: «Выбор САПР не должен существенно осложнять процесс подбора персонала». В большинстве средних и мелких городов это требование сужает круг допустимых САПР до «Компаса» и «Автокада». Запуск этих программ под Wine может оказаться сложной задачей, и однозначно приведёт к снижению быстродействия. Стоимость windows тонет в стоимости этих программ. Нет никакого смысла ставить их на что либо, кроме windows. И заметьте, причина тут не техническая, а кадровая. Ситуация была бы диаметрально противоположной, в случае доступности специалистов способных работать в свободных САПР.

Перечислю другие подразделения и рабочие места, где может «всплыть» windows.

Финансовый отдел
  • АРМ клиент-банк

Программы «клиент-банк» изначально разрабатываются под windows, и даже если вы запустите конкретный клиент-банк под Ubuntu, то нет никакой гарантии, что следующая его версия будет работать. Кроме того, предприятие может завести расчётный счёт в другом банке, и вы снова окажетесь перед проблемой.

В последнее время многие банки переводят свои клиентские пакеты в web. Стоит проверить, могут ли такие клиент-банки жить в чём-либо кроме MS IE. FIXME

  • АРМ специалиста по работе с кредитными отделами банков.

Банки любят присылать для заполнения и обратной отправки сложные и к тому же скриптованные документы MS Office. Если вести документооборот такого рода, используя только Open Office, то вы обязательно потеряете часть невосполнимого запаса нервных клеток.

Юридический отдел FIXME

Сетевая СПС Консультант+ не хочет так же легко запускаться под wine, как под windows - здесь нужно HOWTO

В то же время, в существует множество сообщений о работе различных СПС под wine.

Отдел экологии

В этом отделе обычно присутствуют специализированные программы для оформления отчётов в различные проверяющие конторы и министерства.

Бухгалтерия
  • Специалисты по внешней отчётности

Хорошо, что государство бесплатно распространяет программы для сдачи различных отчётов в электронном виде. Плохо, что разработчики этих программ не могут перейти на кросс-платформенные средства разработки. Но снова хорошо то, что многие из этих программ идут под wine. Краткое и простое руководство по установке включено в официальную документацию «Налогоплательщика ЮЛ». Нужны HOWTO FIXME

Конечно, администратору сети крупного предприятия проще поставить на соответствующее рабочее место в бухгалтерии windows.

  • Бухгалтерия на 1С

Как раз в этом случае существуют различные способы обойтись без windows. FIXME

Отдел кадров

Программы по фондов пенсионного и медицинского страхования разработаны для windows и dos. Конечно же и в этом случае существует вероятность запуска этих программ под эмулятором. Причём, для досовых частей - почти стопроцентная.

Сметчики

Гранд-смета под wine не видит ключа защиты. Не известно, как ведут себя её аналоги и конкуренты FIXME

Энергослужба

Здесь windows понадобится различным программам автоматизированного учета расхода энергии и энергоносителей. А системы АСКУЭ так и вовсе идут только в комплекте с MS SQL. Правда, да же железо там должно быть сертифицированное, так что это уже совершенно отдельный аппаратно-программный комплекс

Печать графики на матричные принтеры

Из Ubuntu печать на матричные принтеры идёт плохо, очень плохо.

Как вы понимаете, печать текстовых документов из Open Office - это то же печать графики с точки зрения матричного принтера.

Конструкторский отдел и прочие «САПёРы»

Причины вы уже знаете.

«САПёРами» в частности могут оказаться электрики или отдел по надзору за сооружениями.

IT служба

Нужно иметь там как минимум одну Windows «для всяких дел»

Если ваша БД - MS SQL сервер, то основным разработчикам понадобится Windows.

Хотя эксперименты в этом направлении ещё ведутся FIXME

Ну вот и всё. Львиная доля компьютеров на предприятии может обойтись без windows. Если я что-то упустил - дополните этот список, но только прошу вас при этом основываться на реальном практическом опыте, а не на теоретических измышлениях.
Ещё более важно выкладывать сюда описание способов «избавления» от windows в виде подробных пошаговых руководств (HOWTO). FIXME

Приведу примеры мест, где вполне можно «утопить» windows:

Редакция производственной газеты

Вместо Adobe Page Maker для этой задачи вполне сгодится Scribus, редактор переобучился довольно быстро. И следующий то же.

Неторопливые операции с растровыми изображениями

Регулировка яркости/контраста, фильтры, вырезание, компоновка, мелкая подделка документов (а какое предприятие в нашей стране обходится без этого) - всё, для чего обычно ставили пиратский Photoshop.

Со всем этим отлично справляется Gimp. А поставить его можно практически на каждый компьютер.

Adobe Photoshop имеет смысл ставить лишь там, где имеется большой объём работ и шустрый специалист высокой квалификации. В противном случае предприятие ничего не выиграет.

Программы на Delphi

Delphi мало использует различные навороты от MS, и большинство программ на ней пойдут под Wine без серьёзных проблем.

BeerSeller запустил ERP производства OOO Алгоритм г.Гродно. Эта программа работает с Oracle через DOA (Direct Oracle Access).

В другом случае удалось запустить учётные системы работающие с MS SQL как через BDE так и через ADO (MDAC).

Программы для DOS

Большинство программ для DOS замечательно работают под DOSemu

Просто для ясности: конечно же windows не понадобится на тех рабочих местах, где используется только офис, интернет и электронная почта (секретари, машинистки, менеджеры и, пардон, «офисный планктон»)